世青篇故事环绕日本队在大空翼带领下参加世青杯。本篇有两个序幕,分别介绍了两个新角色“太阳王子”葵新伍和“神之子”山达拿的出场。而大空翼已经成为了巴西职业足球队圣保罗的10号球员。“神之子”山达拿的经典金句为:“我故意不让守门员碰到足球,以免弄断他的手腕。”(出现于第一期有些人注定只是过客,而有些过客,却会在心中留下永恒的印记。
故事早段描述日本队进军世青杯决赛周的过程,由于日向、岬、政夫、和夫、次藤、早田、新田七个主力球员被逐出球队,日本青年军仅余下翼、三杉、守中卫、佐野及石崎等球员可用,晋级过程艰辛,其中对泰国一役更有翼中途伤出,幸好源三及新伍及时加入,令日本青年军顺利以外围赛冠军身份晋身决赛周。
晋身决赛周的日本队虽然有多名主力实力得以提升并归队,但中场球员岬却遇上车祸未能参赛。及后日本队在大空翼、日向及松山等球员坐镇下、再加上新伍及赤井等新加入球员的出色表现,先后击退空中战强队墨西哥、攻击力极强的乌拉圭、伤兵累累的意大利、欧洲劲旅瑞典及荷兰,杀入决赛,对手是从未交手的巴西。
在对巴西一役,岬于下半场带伤复出,而比赛尾段出场的巴西队10号后备球员拿度尼更成为了大空翼的最强对手。最后日本于加时击败巴西成功夺得世青杯冠军。